Nota de prensa


29/11/2012
BG7, el sistema de anotación Open Source de genomas bacterianos de Era7 Bioinformatics es publicado en PLOS ONE
BG7
El sistema de anotación de genomas bacterianos BG7 de Era7 Bioinformatics está especialmente diseñado para datos de Next Generation Sequencing.
 
Las bacterias se pueden encontrar a lo largo de todo el mundo involucradas en circunstancias tanto buenas como malas. Algunas de ellas son la causa de graves enfermedades infecciosas y otras son responsables de la fermentación de algunos alimentos, la producción de biofuel o incluso son necesarias para mantenernos sanos, formando parte de nuestra flora intestinal o bucal. Así, existe un gran interés en conocer sus genomas y de hecho más de la mitad de toda la información genómica disponible hoy día es de bacterias. Las tecnologías Next Generation Sequencing han cambiado radicalmente el escenario de la adquisición de información genómica mediante la bajada de los precios por un factor de más de un millar en los últimos cinco años. Nuevos métodos, especialmente diseñados para los datos extraidos de Next Generation Sequencing, son necesarios para analizar los genomas bacterianos.

El sistema de anotación de genomas bacterianos BG7 está especialmente diseñado para los datos de Next Generation Sequencing. BG7 tolera los típicos errores de los datos de NGS y es capaz de conseguir una buena anotación funcional para un genoma de bacteria ya en la primera fase borrador incluso si el genoma está fragmentado en miles de contigs. Un enfoque original que integra, en un solo paso, la predicción génica y la anotación funcional, hace posible que el rendimiento con el que se trabaja con los datos de genomas bacterianos por NGS sea óptimo.

El sistema open source BG7 que fue utilizado con éxito el año pasado para conseguir una de las primeras anotaciones del genoma del brote de E. coli alemán (https://github.com/ehec-outbreak-crowdsourced/BGI-data-analysis/wiki) acaba de ser publicado en la revista de libre acceso PLOS ONE: http://dx.plos.org/10.1371/journal.pone.0049239.

Era7 Bioinformatics (www.era7bioinformatics.com) es un proveedor de servicios de Next Generation Sequencing especializado en genómica microbiana. Su modelo de negocio se basa en ofrecer soluciones completas e integradas, desde el diseño de proyectos a exhaustivos análisis e informes bioinformáticos. Era7 Bioinformatics se cimienta en la Investigación, Cloud Computing, Open Source y la especialización en el área del conocimiento.
 
 
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