Nota de prensa


21/02/2016
Nace GreeNC, la primera base de datos de ARNs no codificantes en plantas
Los cofundadores de Sequentia, Walter Sanseverino (izquierda) y Riccardo Aiese Cigliano (derecha) con la gerente de la compañía, Chiara Sanseverino (Foto: Daniel Portales, Parc Científic de Barcelona).
La biotecnológica Sequentia Biotech, con sede en el Parc Científic de Barcelona (PCB), ha desarrollado la primera base de datos de ARN no codificante en especies vegetales: GreeNC.
 
Se trata de un repositorio de más de 200.000 lncRNAs anotados en 37 clases de plantas y 6 algas que proporciona información sobre la secuencia, coordenadas genómicas, potencial de codificación y plegado de energía para todos los lncRNAs identificados.

Los lncRNAs (Long non-coding RNAs) son moléculas de ARN (ácido ribonucleico) no codificante –es decir, que no originan proteínas–, pero que tienen un papel clave en la regulación de la expresión de los genes y en importantes procesos de la biología celular. En el genoma humano pueden actuar, por ejemplo, como oncogenes o genes supresores de tumores, en función de la vía en la cual participan, o si regulan positivamente o negativamente.

Por lo que respecta a las plantas, a pesar de ser un área de investigación hasta ahora muy poco explorada, estudios validados experimentalmente han demostrado que los lncRNAs regulan importantes características agronómicas, tales como la respuesta al ayuno de fosfato, el tiempo de floración y la interacción con organismos simbióticos, haciéndolos de gran interés en la biología y cría de la planta.

“Nuestro objetivo es ofrecer a toda la comunidad científica una innovadora herramienta de predicción bioinformática y repositorio de lncRNAs de plantas que pueda dar un impulso a la investigación de estas importantes moléculas. Gracias a GreeNC, científicos de todo el mundo tienen la oportunidad de acceder fácilmente a toda la información sobre los lncRNAs de plantas y compartir sus resultados”, explica Riccardo Aiese Cigliano, cofundador de Sequentia.


Reducir la brecha entre los datos genómicos y su interpretación

Sequentia centra su actividad en el sector de la bioinformática, la genómica aplicada y la biotecnología verde. Fundada por dos jóvenes investigadores italianos, Riccardo Aiese Cigliano y Walter Sanseverino, su misión es crear know-how propio con el objetivo de mejorar la accesibilidad a la información producida por las tecnologías de secuenciación de nueva generación (Next Generation Sequencing, NGS) para conseguir un desarrollo sostenible que ayude a la mejora de la calidad de los alimentos, la conservación del medio ambiente y la salud humana.

La empresa diversifica su actividad en varios departamentos: SequentiaGreen, (biotecnología, bioinformática y genómica aplicada al sector vegetal), SequentiaHealth (estudio del genoma humano con finalidades clínicas y diagnósticas), SequentiaResearch (I+D en nuevas tecnologías, participación en investigaciones internacionales y trabajos científicos) y SequentiaTraining (actividades de formación y divulgación científica).

“Nuestra última finalidad consiste a crear innovación en el ámbito genómico y de la biotecnología verde con el fin de mejorar los cultivos, reducir los precios y aumentar la disponibilidad de tratamientos farmacéuticos contra diferentes enfermedades en los países más necesitados. Estamos convencidos que estos dos sectores constituyen un recurso estratégico y sostenible para la protección del medio ambiente, la preservación de la biodiversidad y el bienestar de la humanidad y del planeta", afirma Walter Severino, cofundador y CEO de Sequentia.

Gracias a su departamento SequentiaResearch, este mes de enero la compañía ha estado entre las 5 finalistas españolas del concurso internacional de emprendimiento social 'The Venture’ con su proyecto Artepharming, co-financiado por el Ministerio de Economía y Competitividad, que apunta a investigar el desarrollo de biotecnologías a partir de la planta de Artemisia annua que tiene efectos positivos en la lucha contra la malaria, como lo ha demostrado la ganadora del Nobel de Medicina de 2015, la investigadora china Youyou Tu.


Un ‘Know-how’ validado por prestigiosas publicaciones científicas

Sequentia es una de las empresas de referencia en el ámbito de la genómica aplicada a la biotecnología verde. Sus pipelines bioinformáticos se han utilizado para realizar numerosos trabajos de investigación en el campo de la agricultura biofarmacéutica (biopharming), y sus cofundadores han publicado importantes estudios en revistas científicas de la talla de Nature, PNAS o EMBO.

La secuenciación de una cepa no tóxica del hongo Aspergillus carbonarius, publicada en Nature Reports (doi:10.1038/srep09086); la secuenciación del genoma de una variedad de patata, Solanum commersonii, publicada en Plant Cell como artículo de portada (doi: 10.1105/tpc.114.135954); o el primer análisis exhaustivo de la diversidad genética del melón, publicado en Molecular Biology and Evolution (doi: 10.1093/molbev/msv152), son tres de las siete publicaciones científicas en las que han participado Riccardo Aiese Cigliano y Walter Sanseverino de Sequentia tan sólo el año pasado.

Sanseverino también formó parte del equipo de investigadores que secuenció en 2012 el genoma del melón. Fue la primera vez que un consorcio publicoprivado del Estado español consiguió un genoma completo de una especie superior de plantas (con flor y frutos) y, además, mediante nuevas tecnologías de secuenciación masiva. El trabajo (doi: 10.1073/pnas.1205415109) se publicó Proceedings of the National Academy of Sciences (PNAS).
 
 
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