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Juan Basterra (Mikrobiomik) | “En los últimos 10 años se han dado pasos decisivos para entender y valorar el papel que desempeña nuestra microbiota intestinal”

Mikrobiomik trabaja para convertirse en la primera compañía a nivel global que comercialice en la Unión Europea el primer medicamento biológico basado en microbiota intestinal en la indicación de recurrencia por ‘Clostridium difficile’, a través de la administración de MBK-01.

Juan Basterra, CEO Mikrobiomik
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Durante la última década, el término "microbioma" ha ganado popularidad gracias a los avances científicos que han destacado su papel crucial en la salud humana y animal. En el caso de la microbiota intestinal, en este tiempo se han dado pasos decisivos para entender y valorar el papel que desempeña a la hora de garantizar nuestra salud. El aumento de este conocimiento nos ha permitido identificar más de 300 enfermedades relacionadas con una alteración o cambios en la microbiota.

Con motivo de la celebración este 27 de junio del Día Mundial del Microbioma entrevistamos a Juan Basterra, CEO de Mikrobiomik, compañía biotecnológica nacida para investigar, desarrollar y fabricar medicamentos biológicos basados en la microbiota intestinal. 

AseBio. ¿Qué es el microbioma y por qué juega un papel tan importante para la salud humana?

Juan Basterra. La microbiota es el conjunto de microorganismo que viven y conviven en el interior del cuerpo humano. El microbioma es el genoma de todos los microorganismos de la microbiota. El término microbioma es mucho más amplio, por lo tanto, que el de microbiota, ya que incluye el conjunto de comunidades microbianas, genes y metabolitos, así como las condiciones ambientales que los rodean.

Podemos hablar de cinco microbiotas principales: la del intestino, que incluye una comunidad de organismos microscópicos que viven dentro de nuestro tubo digestivo y más en concreto en nuestro colon; el respiratorio; el cutáneo; el urogenital y el bucal. 

AseBio. ¿En qué se diferencia de la microbiota?

Juan Basterra. La microbiota es el conjunto de todos los microorganismos que forman parte de nuestro organismo (bacterias, hongos, virus, arqueas, virus, hongos y protistas). Los seres humanos tienen el mismo número de células que de bacterias. Somos mitad humanos, mitad microbios la mayor diversidad bacteriana se encuentra en nuestro tracto gastrointestinal. 

AseBio. ¿Cómo ha cambiado nuestra comprensión del microbioma en los últimos años? ¿Qué papel ha jugado la biotecnología?

Juan Basterra. El biólogo estadounidense Jeffrey Gordon, pionero en este campo e impulsor del Proyecto Microbioma Humano, descubrió que la función principal de las bacterias que habitan en nuestro intestino es evitar las enfermedades. Las diferentes investigaciones publicadas por este doctor de la Universidad de Chicago en los últimos 20 años han confirmado que, el desequilibrio de la microbiota, está relacionado con enfermedades como la diabetes, la obesidad o la desnutrición, pero también afecta en a nuestro desarrollo neurológico e inmunitario. 

Además, en los últimos 10 años se han dado pasos decisivos para entender y valorar el papel que desempeña nuestra microbiota intestinal que no hubieran sido posibles sin aplicar el conocimiento previo sobre otros microorganismos y sus procesos metabólicos. 

En el mundo científico ya no hay ninguna duda sobre la conexión entre el intestino y el cerebro, ya que nuestro intestino contiene más de 100 millones de neuronas, más neuronas que la médula espinal. Además, se sabe que el intestino y el cerebro se comunican y forman lo que se llama ‘eje intestino-cerebro’, que influye en muchos aspectos de nuestras neuronas. Este avance puede ser fundamental para el abordaje de potenciales tratamientos para enfermedades neurodegenerativas u otras relacionadas con nuestra salud mental, como la ansiedad y la depresión.

También se conoce que la microbiota intestinal determina la glucemia y que el ciclo circadiano está conectado con el ritmo de la microbiota intestinal, lo que abre nuevas posibilidades en el ámbito de la diabetes, por ejemplo.

A nivel inmunológico, los investigadores también han observado por una parte que la microbiota intestinal puede modular la toxicidad de la terapia contra el cáncer y por otra, que las personas que responden a la inmunoterapia tienen una microbiota intestinal más diversificada, lo que se vincula a un consumo elevado de fibra.   

Se han descrito más de 300 enfermedades relacionadas con una alteración o cambios en la microbiota. Muchas veces no sabemos si ese cambio en la microbiota es la causa o el efecto de la enfermedad, pero cada vez hay más datos que sustentan que hay una relación entre ambos.

Los avances científicos en este campo tan excepcional se centran en obtener medidas preventivas, diagnósticas y terapéuticas basadas en la microbiota, si bien la microbiota puede desempeñar un papel fundamental en el tratamiento de muchas enfermedades cuya causa aún se desconoce. 

Hay un amplio campo de investigación por delante que sin duda se traducirá en desarrollos clínicos importantes. Y nosotros estamos aportando nuestro granito de arena.

En Mikrobiomik hemos desarrollado el primer medicamento biológico (MBK-01) en cápsulas orales basado en microbiota intestinal que será comercializado en la UE con tecnología FSPIM (Full Spectrum & Purified Intestinal Microbiota), que contiene todo el ecosistema bacteriano procedente de un donante sano validado, en una sola cápsula.

Nuestra aproximación terapéutica se basa en el trasplante de microbiota intestinal, lo cual no es nuevo (ya lo practicaban médicos tradicionales chinos hace 1.700 años). Pero nuestra aportación es hacer realidad el futuro con nuestras cápsulas por vía oral de microbiota intestinal con los máximos estándares de seguridad y calidad; siguiendo todos los protocolos y procedimientos inherentes al desarrollo de medicamentos.

AseBio. ¿Qué avances recientes se han hecho en la investigación del microbioma?

Juan Basterra. Hace pocas semanas se publicaba un estudio liderado por el Consejo Superior de Investigaciones Científicas (CSIC) que ha descubierto la presencia de amiloides bacterianos asociados con la enfermedad de Parkinson en la microbiota intestinal.

El hallazgo, que se publica en la revista Nature Communications, podría aportar herramientas para hacer un diagnóstico precoz de esta patología, que afecta a más de siete millones de personas en el mundo. Es un hito relevante porque las enfermedades neurodegenerativas relacionadas con la edad que implican agregación amiloide, siguen siendo uno de los mayores retos de la medicina moderna. 

En un futuro nos planteamos poder abordar este tipo de enfermedades desde Mikrobiomik con nuestro medicamento biológico MBK-01, desde mejorar la calidad de vida de los pacientes autistas, hasta influir, desde el punto de vista de la mejora en la respuesta inmunitaria, de los pacientes con ELA.

AseBio. Mikrobiomik cuenta con la primera y única instalación GMP (Good Manufacturing Practices) dedicada, en exclusiva, a la fabricación de medicamentos biológicos derivados de la microbiota intestinal. ¿Cómo se elaboran estos? ¿Cómo seleccionáis las muestras que finalmente son aptas para el desarrollo de estos medicamentos?

Juan Basterra. En Mikrobiomik hemos iniciado una nueva ronda de inversión de hasta ocho millones de euros que se destinarán a la construcción de una nueva planta de producción a escala industrial ya que, actualmente, contamos con una planta piloto GMP de producción limitada de MBK-01 y está autorizada para producir MBK-01 exclusivamente para ensayos clínicos y usos compasivos. La construcción de una nueva planta permitirá multiplicar por 10 nuestra producción actual para dar respuesta a la demanda esperada del mercado.

La hoja de ruta de Mikrobiomik, además de la ampliación de instalaciones productivas, incluye la creación de una red pionera de centros de donación de heces en España. Para nosotros este aspecto también es esencial ya que, a partir de las heces y a través de un proceso tecnológico innovador, en Mikrobiomik separamos y purificamos la microbiota, transformándola finalmente en una cápsula de 250 mg. 

El proceso de donación de heces está rigurosamente controlado para garantizar que sólo se utilizan las heces de donantes sanos, validados y comprometidos, dispuestos a realizar entre 2-5 donaciones a la semana durante dos meses. Un equipo médico que supervisa que se cumplen todos los requisitos: cuestionario de salud online, entrevista médica personal a los donantes y pruebas médicas (incluyen análisis de sangre y heces).

AseBio. Mikrobiomik trabaja para convertirse en la primera compañía a nivel global que comercialice en la Unión Europea el primer medicamento biológico basado en microbiota intestinal en la indicación de recurrencia por ‘Clostridium difficile’ a través de la administración de MBK-01 (4 cápsulas de microbiota fecal liofilizada) en una sola toma. ¿En qué punto os encontráis?

Juan Basterra. Decimos con orgullo que, por primera vez en la historia de la industria farmacéutica en el País Vasco, un medicamento investigado, desarrollado y producido en Bizkaia, ha sido calificado por la EMA (Agencia Europea de Medicamentos) como una nueva sustancia activa, lo que nos otorga 10 años de exclusividad de mercado y nos permite seguir un procedimiento de autorización centralizado, que permitirá que MBK-01 esté disponible para todos los pacientes y profesionales sanitarios de la UE en base a una autorización de comercialización única, que es válida en todos los Estados miembros de la UE.

En estos momentos, ya hemos iniciado el proceso regulatorio y esperamos obtener la autorización de comercialización de la Comisión Europea en el primer trimestre de 2025, previa recomendación favorable por parte de la EMA prevista para el segundo semestre de 2024. Lanzaremos MBK-01 en el primer semestre del 2025, después de años de esfuerzo y gracias al talento del equipo Mikrobiomik, del que me siento muy orgulloso.

No obstante, actualmente el uso compasivo de MBK-01 para la infección por Clostridium difficile (ICD) está autorizado en España por la AEMPS. Este programa de uso compasivo ha beneficiado a decenas de pacientes hasta la fecha. 

AseBio. ¿Qué desafíos enfrenta actualmente la investigación del microbioma? En base a vuestra experiencia, ¿qué áreas de la investigación del microbioma considera más prometedoras para el futuro?

Juan Basterra. Es un campo con un potencial extraordinario. Se está avanzando en investigaciones sobre las moléculas que producen los millones de microorganismos que viven en nuestro sistema digestivo, en su capacidad de interferir con nuestras proteínas y de influir en el desarrollo de enfermedades. Entre ellas las neurodegenerativas, por ejemplo. 

Además, el estudio de su influencia en los caracteres visibles resultantes de la interacción del genotipo y el medio contribuirán al avance de la medicina personalizada que, a futuro, incluirán un análisis del microbioma –del genotipo de la microbiota individual- para proponer tratamientos más personalizados que puedan tener también en cuenta el impacto de microbios, etc., en cada sujeto tratado.

Y en el caso de Mikrobiomik, tenemos por delante constatar científicamente el potencial de nuestro primer medicamento biológico basado en la microbiota intestinal, MBK-01, en diversas patologías. Queremos evaluar si recuperar o restituir una microbiota sana de una forma sencilla y eficaz puede ser una alternativa terapéutica en el manejo de diversas enfermedades.

De momento, vamos a ser la primera compañía del mundo en llevar al mercado el primer medicamento biológico basado en microbiota intestinal (MBK-01) como tratamiento en la infección primaria o recurrente por Clostridium difficile (ICD), que causa episodios repetidos de diarrea, dolor abdominal y fiebre.

Nuestro pipeline incluye otras tres indicaciones:  el tratamiento de la disfunción metabólica asociada a la esteatohepatitis (MASH), conocida también como hígado graso, cuya fase II de ensayo clínico se iniciará en 2024, al igual que una fase IIa, para el tratamiento de la diverticulitis aguda no complicada.  También tenemos previsto iniciar una prueba de concepto para el tratamiento del cáncer metastásico colorrectal que no responde a 2-3 líneas de tratamiento.